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RFLP限制性片段长度多态性
限制性片段长度多态性(Restriction fragment length polymorphism, RFLP)被认为是检测SNP最简单、最早的方法。SNP-RFLP利用了许多不同的限制性内切酶及其对独特和特异的限制性内切位点的高亲和力。通过对基因组样本进行消化并通过凝胶分析确定片段长度，可以确定酶是否切断了预期的限制性内切位点。如果出现了一个大于预期的可识别的片段，说明切割基因组样本失败了，这也就说明在限制位点上有一个突变，使其对核酸酶活性具有保护作用。
不幸的是，由于大多数真核生物基因组的高度复杂性、对特异内切酶的要求、无法在单一实验中解决精确突变的事实以及凝胶分析的缓慢性质等因素的综合作用，使得RFLP在高通量分析的方法中成为很不好的选择。
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